80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1245 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  41.19 
 
 
326 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.1 
 
 
318 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.17 
 
 
336 aa  194  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.08 
 
 
322 aa  193  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.58 
 
 
318 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  37.58 
 
 
325 aa  188  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.5 
 
 
320 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  33.99 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.81 
 
 
320 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.65 
 
 
353 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  34.51 
 
 
325 aa  181  9.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.08 
 
 
349 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.54 
 
 
314 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.33 
 
 
326 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.17 
 
 
325 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.17 
 
 
325 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  42.86 
 
 
321 aa  170  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  33.65 
 
 
319 aa  169  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.26 
 
 
316 aa  168  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  40.09 
 
 
315 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  42.79 
 
 
312 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  42.79 
 
 
312 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  35.43 
 
 
315 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.42 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.55 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.81 
 
 
318 aa  162  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.08 
 
 
312 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.08 
 
 
312 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  33.23 
 
 
365 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.65 
 
 
336 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.42 
 
 
363 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  33.44 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.09 
 
 
312 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.59 
 
 
310 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.88 
 
 
329 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  39.32 
 
 
319 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.28 
 
 
312 aa  133  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  32.03 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  32.58 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  37.89 
 
 
195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  33.66 
 
 
321 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.12 
 
 
314 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  29.77 
 
 
326 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  26.69 
 
 
309 aa  123  3e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  29.54 
 
 
323 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  35.68 
 
 
316 aa  123  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  29.71 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  30.66 
 
 
278 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  30.31 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  30.74 
 
 
353 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  32.23 
 
 
262 aa  106  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  34.96 
 
 
294 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  27.31 
 
 
271 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  33.85 
 
 
355 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  41.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  34.32 
 
 
267 aa  99.4  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  41.48 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  29.51 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  32.04 
 
 
358 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  38.27 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  31.33 
 
 
609 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  35.48 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  29.24 
 
 
587 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  29.24 
 
 
584 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  29.83 
 
 
598 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  28.51 
 
 
587 aa  73.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  24.79 
 
 
618 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  30.43 
 
 
339 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  25 
 
 
505 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  28.51 
 
 
680 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  33.8 
 
 
349 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  28.4 
 
 
364 aa  59.3  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  25.31 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4035  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.67 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0762844  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2098  mannose-6-phosphate isomerase  37.84 
 
 
398 aa  50.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.302925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.53 
 
 
391 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.53 
 
 
391 aa  42.7  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  30.53 
 
 
391 aa  42.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.53 
 
 
391 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>