71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  100 
 
 		 349 aa  692    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  58.24 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  44.51 
 
 		 680 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  30.03 
 
 		 364 aa  166  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  26.89 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.03 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.36 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.07 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.78 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.54 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.34 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.43 
 
 		 325 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.05 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  27.6 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  28.23 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.13 
 
 		 312 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  30.6 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  28.46 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  32.17 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.29 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  26.84 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  29.08 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  24.3 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  27.35 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  31.34 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.61 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.61 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  31.34 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  26.59 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  22.58 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.95 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  33.77 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  26.77 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.48 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  37.07 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  26.27 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  37.07 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  24.8 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  28.91 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  33.96 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.71 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  35.11 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  34.43 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  22.74 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  41.35 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  35.4 
 
 		 195 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  27.24 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  23.79 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  23.1 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  37.39 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  36.52 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  25.73 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  33.8 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  27.61 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  30.6 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  36.36 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.48 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  32.35 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  29.32 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  26.83 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  20.4 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  30.43 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  34.4 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  31.19 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  27.12 
 
 		 271 aa  53.1  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  24.31 
 
 		 584 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  25.25 
 
 		 609 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  25.72 
 
 		 598 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  24.34 
 
 		 587 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6006  mannose-6-phosphate isomerase class I  30.16 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000013531  normal  0.0800927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>