87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3397 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  100 
 
 
318 aa  662    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  77.99 
 
 
320 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  57.23 
 
 
314 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  55.95 
 
 
315 aa  361  7.0000000000000005e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  53.02 
 
 
315 aa  350  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  52.87 
 
 
315 aa  342  4e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  51.13 
 
 
312 aa  340  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  51.13 
 
 
312 aa  340  2e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  50.79 
 
 
322 aa  335  5e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  50.64 
 
 
310 aa  334  9e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  49.04 
 
 
316 aa  331  8e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  49.05 
 
 
336 aa  315  5e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.73 
 
 
312 aa  308  8e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  46.08 
 
 
321 aa  305  6e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.05 
 
 
312 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.05 
 
 
312 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  46.08 
 
 
319 aa  276  4e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.95 
 
 
314 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.87 
 
 
318 aa  257  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.63 
 
 
353 aa  238  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.01 
 
 
318 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  59.78 
 
 
195 aa  235  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.78 
 
 
312 aa  233  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.31 
 
 
325 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.31 
 
 
325 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.94 
 
 
329 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  35.24 
 
 
309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.96 
 
 
349 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.05 
 
 
363 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.15 
 
 
319 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  34.95 
 
 
319 aa  194  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.45 
 
 
320 aa  189  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  37.58 
 
 
306 aa  189  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  33.55 
 
 
325 aa  186  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  34.84 
 
 
323 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  37.58 
 
 
369 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  36.63 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.17 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.94 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  35.31 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  35.39 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  35.53 
 
 
326 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  35.4 
 
 
353 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.21 
 
 
336 aa  160  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  34.27 
 
 
316 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  32.49 
 
 
344 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  33.01 
 
 
325 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  36.48 
 
 
326 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  35.54 
 
 
321 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  35.86 
 
 
278 aa  143  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  34.94 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  39.15 
 
 
262 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.45 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  34.89 
 
 
323 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  32.74 
 
 
271 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  30.25 
 
 
358 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  39.49 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  35.41 
 
 
268 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  33.85 
 
 
315 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  27.02 
 
 
355 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  35.48 
 
 
294 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  27.6 
 
 
680 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  26.29 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  32.74 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  27.31 
 
 
364 aa  86.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  28.05 
 
 
339 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  26.76 
 
 
505 aa  82.4  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  27.67 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  27.54 
 
 
598 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  22.09 
 
 
618 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  22.81 
 
 
587 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  23.6 
 
 
587 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  24.11 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  22.78 
 
 
584 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1576  hypothetical protein  44 
 
 
59 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2030  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.64 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0478981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01572  hypothetical protein  33.64 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1821  mannose-6-phosphate isomerase  33.64 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.280304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01582  mannose-6-phosphate isomerase  33.64 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1830  mannose-6-phosphate isomerase  32.98 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725153 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0410  mannose-6-phosphate isomerase, class I  31.43 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2323  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.98 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.734399  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1799  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.98 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2017  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.98 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1688  mannose-6-phosphate isomerase  32.98 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1586  mannose-6-phosphate isomerase, class I  32.98 
 
 
391 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.762503  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05183  mannose-6-phosphate isomerase  32.73 
 
 
410 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>