73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1575 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 195 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  70.65 
 
 		 322 aa  285  2.9999999999999996e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  60.54 
 
 		 315 aa  247  8e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  61.62 
 
 		 315 aa  246  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  61.75 
 
 		 315 aa  244  4.9999999999999997e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  60.87 
 
 		 312 aa  242  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  60.87 
 
 		 312 aa  242  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  60.54 
 
 		 321 aa  241  6e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  59.78 
 
 		 318 aa  235  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  58.06 
 
 		 314 aa  234  9e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  59.14 
 
 		 316 aa  234  9e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  58.06 
 
 		 320 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  51.91 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  51.1 
 
 		 336 aa  211  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  55.38 
 
 		 319 aa  209  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  52.2 
 
 		 310 aa  204  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  50.29 
 
 		 312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  46.28 
 
 		 312 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  46.28 
 
 		 312 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.45 
 
 		 353 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  43.85 
 
 		 309 aa  171  9e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.62 
 
 		 314 aa  162  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  44.5 
 
 		 319 aa  161  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.62 
 
 		 325 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.62 
 
 		 325 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.05 
 
 		 363 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.08 
 
 		 329 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.65 
 
 		 312 aa  153  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.58 
 
 		 320 aa  152  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  41.71 
 
 		 328 aa  145  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.33 
 
 		 318 aa  144  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.7 
 
 		 349 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  40.51 
 
 		 344 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.46 
 
 		 326 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  39.15 
 
 		 365 aa  134  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 369 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  37.56 
 
 		 319 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  41.08 
 
 		 325 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  36.65 
 
 		 325 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  41.01 
 
 		 326 aa  129  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35.45 
 
 		 322 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  38.62 
 
 		 325 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  37.89 
 
 		 306 aa  127  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.57 
 
 		 336 aa  125  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  37.69 
 
 		 323 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  41.4 
 
 		 316 aa  125  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  41.24 
 
 		 353 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  39.13 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  38.17 
 
 		 326 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  38.79 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  38.22 
 
 		 321 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  38.46 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  38.1 
 
 		 273 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  40.3 
 
 		 268 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  42.75 
 
 		 267 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  44.86 
 
 		 307 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  31.22 
 
 		 358 aa  97.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  40.68 
 
 		 315 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  31.98 
 
 		 355 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  36.51 
 
 		 294 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  32.12 
 
 		 271 aa  91.3  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  36.84 
 
 		 323 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  35.4 
 
 		 349 aa  72  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  31.3 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  32.52 
 
 		 680 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  32.77 
 
 		 339 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  32 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  27.03 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  29.32 
 
 		 587 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  27.48 
 
 		 598 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  26.39 
 
 		 618 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  27.48 
 
 		 587 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02370  mannose-6-phosphate isomerase  31.73 
 
 		 434 aa  42.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.943759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>