76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1263 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1263  phosphomannose isomerase  100 
 
 
321 aa  655    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000784939  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0249  phosphomannose isomerase  53.8 
 
 
322 aa  365  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.289498  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0819  mannose-6-phosphate isomerase  50.78 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3397  mannose-6-phosphate isomerase, class I  46.08 
 
 
318 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3528  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.77 
 
 
320 aa  299  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1171  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.11 
 
 
314 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1708  mannose-6-phosphate isomerase  46.25 
 
 
315 aa  287  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.657704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2261  mannose-6-phosphate isomerase, class I  46.15 
 
 
316 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1688  mannose-6-phosphate isomerase, class I  46.39 
 
 
315 aa  275  9e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.745586  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0314  mannose-6-phosphate isomerase, class I  45.43 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000281347  normal  0.468377 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2722  mannose-6-phosphate isomerase  43.67 
 
 
312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2666  mannose-6-phosphate isomerase  43.67 
 
 
312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0141  mannose-6-phosphate isomerase, class I  43.77 
 
 
318 aa  259  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3377  mannose-6-phosphate isomerase, class I  41.77 
 
 
310 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.308254  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1769  phosphomannose isomerase  44.48 
 
 
319 aa  250  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2217  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.68 
 
 
312 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.735941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.68 
 
 
312 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1575  mannose-6-phosphate isomerase  60.54 
 
 
195 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1752  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.1 
 
 
312 aa  236  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0921565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21530  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.56 
 
 
353 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3117  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.03 
 
 
314 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0284496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2149  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.65 
 
 
329 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0475  phosphomannose isomerase type I  37.62 
 
 
309 aa  209  5e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.282321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1319  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.93 
 
 
318 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0119683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1806  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.62 
 
 
319 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12883  putative mannose-6-phosphate isomerase  37.89 
 
 
325 aa  203  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1681  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.53 
 
 
312 aa  202  8e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0465  Mannose-6-phosphate isomerase  38.23 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0458  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.64 
 
 
320 aa  199  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0309  mannose-6-phosphate isomerase, class I  36.53 
 
 
326 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0266  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.06 
 
 
322 aa  193  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1205  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.06 
 
 
325 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1391  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.75 
 
 
325 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0467  mannose-6-phosphate isomerase  36.94 
 
 
328 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1081  mannose-6-phosphate isomerase  34.97 
 
 
369 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1179  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.85 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0511343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3116  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.47 
 
 
363 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0468  mannose-6-phosphate isomerase, class I  33.65 
 
 
336 aa  182  9.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3743  mannose-6-phosphate isomerase  32.91 
 
 
323 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.274174  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1327  Mannose-6-phosphate isomerase  34.78 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0569  mannose-6-phosphate isomerase  35.58 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0885  mannose-6-phosphate isomerase  33.23 
 
 
326 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1723  Mannose-6-phosphate isomerase  42.99 
 
 
344 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1245  Mannose-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 
306 aa  170  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3802  mannose-6-phosphate isomerase  34.85 
 
 
353 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2595  Mannose-6-phosphate isomerase  36 
 
 
325 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0920  Mannose-6-phosphate isomerase  34.89 
 
 
321 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0690486 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0321  mannose-6-phosphate isomerase  32.82 
 
 
316 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000805309  hitchhiker  0.00737279 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1535  mannose-6-phosphate isomerase, type I  40.38 
 
 
262 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1668  mannose-6-phosphate isomerase type I  38.53 
 
 
326 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0844191  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0882  mannose-6-phosphate isomerase type I  35.98 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0193  mannose-6-phosphate isomerase, type I  35.55 
 
 
278 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1783  hypothetical protein  37.81 
 
 
358 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0191  mannose-6-phosphate isomerase type I  36.97 
 
 
278 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1592  phosphomannose isomerase-like protein  40.13 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0743  putative mannose-6-phosphate isomerase  37.44 
 
 
267 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594978  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0457  mannose-6-phosphate isomerase type I  34.48 
 
 
271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2595  phosphomannose isomerase-like protein  31.25 
 
 
355 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0506616  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1059  mannose-6-phosphate isomerase  31.51 
 
 
315 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191159 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2255  Mannose-6-phosphate isomerase  38.14 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0223155  hitchhiker  0.00489167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0924  mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
307 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4499  phosphomannose isomerase-like protein  35.9 
 
 
294 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1482  Phosphomannose isomerase-like protein  25.75 
 
 
505 aa  82.8  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28540  phosphomannose isomerase  26.27 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4282  hypothetical protein  27.47 
 
 
598 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3966  PfkB domain protein  28.69 
 
 
680 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173743  normal  0.0415319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6091  hypothetical protein  25.36 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3010  hypothetical protein  27.73 
 
 
587 aa  76.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0639  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  27.97 
 
 
584 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.459427  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0656  phosphomannose isomerase-like protein  24.9 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.189612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0756  hypothetical protein  26.81 
 
 
587 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.31068  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2266  hypothetical protein  26.81 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2422  mannose-6-phosphate isomerase-like protein  23.53 
 
 
618 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3646  phosphomannose isomerase-like  30.4 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1576  hypothetical protein  40 
 
 
59 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2253  mannose-6-phosphate isomerase, class I  35 
 
 
419 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0483386  normal  0.187903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>