63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0221 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  100 
 
 		 78 aa  155  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  61.43 
 
 		 76 aa  92  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  58.57 
 
 		 75 aa  89.4  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  53.85 
 
 		 71 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  48.57 
 
 		 73 aa  73.6  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  56.52 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  49.35 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  53.03 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  54.55 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  48.48 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  46.97 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  54.69 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  44.62 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  53.03 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  52.86 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  51.56 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  46.88 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  50 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  36 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.78 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  40.3 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  38.46 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  46.03 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  40.3 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.81 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  42.65 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  40.32 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0674  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.1 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.973126  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  36.99 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  34.85 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.92 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1564  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.69 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  34.18 
 
 		 287 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  28 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  38.1 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  28.99 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  31.08 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29422  predicted protein  34.69 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00200613 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  35.38 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  38.24 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  37.5 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1205  like-Sm ribonucleoprotein, core  27.03 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0302379 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  37.5 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  35.14 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.200547 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  36.11 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.11 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  36.11 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  29.58 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0325  hypothetical protein  41.07 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02920  small nuclear ribonucleoprotein E, putative  36.23 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0578232  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  35.09 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1613  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.09 
 
 		 78 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.18064 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  34.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  42 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  32.79 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35063  predicted protein  30 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.36 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2046  Like-Sm ribonucleoprotein core  32.39 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600722  normal  0.0639389 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  41.82 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  36.36 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  30.16 
 
 		 81 aa  40  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  33.33 
 
 		 87 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>