73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0421 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  100 
 
 		 73 aa  145  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  59.72 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  56.94 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  52.11 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  50 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  50 
 
 		 80 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  52.24 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  48.57 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  50.75 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  49.25 
 
 		 72 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  58.93 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  60.71 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  52.05 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  49.32 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  50.77 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  54.41 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  47.69 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  46.88 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  46.15 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  46.15 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  34.29 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  43.08 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  43.08 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  43.08 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  43.08 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  39.53 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  45.45 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  46.27 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.78 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  44.93 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  39.19 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  42.47 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  46.27 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  44.78 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  44 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  45.9 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  49.12 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  39.66 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  44.44 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.91 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35063  predicted protein  37.5 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.32 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  42.42 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.97 
 
 		 287 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0674  Like-Sm ribonucleoprotein core  44.26 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.973126  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.58 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  43.48 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  35.38 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35794  predicted protein  33.33 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03050  pre-mRNA splicing factor, putative  30.49 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.03026  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  37.1 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  38.67 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  42.42 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50048  predicted protein  35.53 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33304  predicted protein  30 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00620413  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  34.62 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  44.83 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  41.82 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  38.1 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.200547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.03 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0325  hypothetical protein  39.58 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1205  like-Sm ribonucleoprotein, core  40.82 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0302379 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1564  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.58 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1613  like-Sm ribonucleoprotein, core  32.26 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.18064 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50259  snRNA-associated protein, Sm class  35.21 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0481772 
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  44.64 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1541  Like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.676832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02650  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0190599  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10561  small nuclear ribonucleoprotein SmB, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07740)  34.78 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.199439 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  32.73 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.62 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  36.76 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  34.92 
 
 		 135 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>