22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46810 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.200547 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  60.42 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  49.46 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  52.75 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  49.41 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  40.28 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  35.62 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  38.1 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.46 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.1 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  35.14 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.51 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.38 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  29.87 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  37.14 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.19 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  32.95 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10752  predicted protein  34.78 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  36.92 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  41.18 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  31.43 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.33 
 
 		 75 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>