56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0093 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  100 
 
 		 76 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  82.67 
 
 		 75 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  84 
 
 		 75 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  80.82 
 
 		 80 aa  124  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  83.56 
 
 		 75 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  65.75 
 
 		 72 aa  94.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  63.01 
 
 		 72 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  63.89 
 
 		 71 aa  92.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  57.14 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  60.71 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  57.14 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  52.63 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  57.14 
 
 		 76 aa  67  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  52.63 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  50.88 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  52.63 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  46.05 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  50 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  45.71 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  45.71 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  45.71 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  46.38 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  44.93 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  43.48 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  38.64 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  43.48 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  43.53 
 
 		 287 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  44.29 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  46.67 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  46.43 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  40 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  44.44 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  40.85 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  44.44 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  45.45 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  36.67 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2046  Like-Sm ribonucleoprotein core  39.24 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600722  normal  0.0639389 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  41.67 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  35.23 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0674  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.43 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.973126  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  47.06 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  48.21 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  48.44 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  40 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  39.73 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  39.13 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.81 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  36.11 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  40.68 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  39.19 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.200547 
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  46.3 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  41.27 
 
 		 100 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  36 
 
 		 87 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  33.33 
 
 		 90 aa  40  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>