27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27053 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  100 
 
 		 72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  55.38 
 
 		 78 aa  76.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20588  predicted protein  54.84 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  47.62 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  37.5 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  45 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  42.62 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  37.29 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  40.28 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.200547 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.27 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  33.33 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  32.79 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35063  predicted protein  33.33 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.09 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06735  small nuclear ribonucleoprotein SmE, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05980)  33.96 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182783 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.51 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  38.81 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.84 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  32.26 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.93 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  39.68 
 
 		 86 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  32.26 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  42 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  34.69 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  32.73 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10752  predicted protein  42.55 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  31.37 
 
 		 80 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>