36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_42488 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  100 
 
 
100 aa  199  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  55.43 
 
 
136 aa  107  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  52.22 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  49.46 
 
 
109 aa  94.7  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.200547 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  48.75 
 
 
131 aa  84.3  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  37.97 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  39.19 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  37.5 
 
 
72 aa  55.1  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  44 
 
 
73 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  42.11 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  40.96 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05400  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm8, putative  37.84 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  37.84 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.49 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  44.78 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.33 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  32.43 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.5 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  45.07 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.33 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  42.86 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35063  predicted protein  38.16 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.84 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  36.49 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.68 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  35.53 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  28.89 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10752  predicted protein  35.44 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10583  predicted protein  41.67 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329173  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.27 
 
 
76 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  34.33 
 
 
78 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.27 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20588  predicted protein  36.23 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50048  predicted protein  34.25 
 
 
225 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  33.77 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10561  small nuclear ribonucleoprotein SmB, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07740)  36.62 
 
 
196 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.199439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>