28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32889 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  100 
 
 		 97 aa  197  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05400  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm8, putative  46.24 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10752  predicted protein  54.65 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  42.47 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50048  predicted protein  38.55 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  37.33 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68190  predicted protein  31.48 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502273  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  35.71 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  37.29 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  33.8 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  38.1 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.200547 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  32.43 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  28.57 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35063  predicted protein  36.62 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20588  predicted protein  35.29 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14893  predicted protein  38.81 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160783  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  32.43 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06735  small nuclear ribonucleoprotein SmE, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05980)  37.04 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182783 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00090  conserved hypothetical protein  36.21 
 
 		 216 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0822069  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  45.45 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32713  predicted protein  36.21 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  35.85 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.76 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  36.99 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 		 79 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  34.29 
 
 		 88 aa  40  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  35.44 
 
 		 72 aa  40  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>