13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10752 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10752  predicted protein  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  54.65 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05400  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm8, putative  59.09 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  39.44 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68190  predicted protein  31.91 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50048  predicted protein  41.89 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  35.53 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  32.81 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  39.06 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  35.44 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  34.78 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.200547 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.92 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  42.55 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>