13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50048 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_50048  predicted protein  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  45.24 
 
 		 126 aa  84.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  33.59 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  38.55 
 
 		 97 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68190  predicted protein  31.18 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502273  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05400  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm8, putative  35.05 
 
 		 95 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10752  predicted protein  41.89 
 
 		 86 aa  49.7  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35063  predicted protein  28.38 
 
 		 165 aa  48.5  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10561  small nuclear ribonucleoprotein SmB, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07740)  35.29 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.199439 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.53 
 
 		 73 aa  46.2  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02650  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 195 aa  45.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0190599  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.36 
 
 		 76 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  34.78 
 
 		 79 aa  42.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>