14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02650 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ02650  conserved hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  368  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0190599  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10561  small nuclear ribonucleoprotein SmB, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07740)  50.44 
 
 
196 aa  108  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.199439 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35063  predicted protein  50 
 
 
165 aa  104  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32971  predicted protein  41.18 
 
 
142 aa  99  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14893  predicted protein  43.64 
 
 
145 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160783  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50048  predicted protein  30 
 
 
225 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 
72 aa  45.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01770  hypothetical protein  26.17 
 
 
214 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  32.81 
 
 
89 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.33 
 
 
73 aa  42.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  34.78 
 
 
79 aa  42  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35698  predicted protein  35.11 
 
 
114 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  34.78 
 
 
71 aa  41.6  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  29.49 
 
 
135 aa  41.6  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>