19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35063 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_35063  predicted protein  100 
 
 		 165 aa  310  4.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14893  predicted protein  52.07 
 
 		 145 aa  114  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160783  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02650  conserved hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0190599  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10561  small nuclear ribonucleoprotein SmB, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07740)  48.65 
 
 		 196 aa  96.7  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.199439 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32971  predicted protein  38.06 
 
 		 142 aa  87.4  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50048  predicted protein  28 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.5 
 
 		 73 aa  48.5  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05400  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm8, putative  34.94 
 
 		 95 aa  47.8  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01770  hypothetical protein  57.58 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  38.16 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  36.62 
 
 		 97 aa  44.3  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  37.84 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  32.91 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  35 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26291  predicted protein  32.84 
 
 		 105 aa  43.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.677772  normal  0.149739 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  34.67 
 
 		 72 aa  42.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.38 
 
 		 80 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  36.92 
 
 		 71 aa  41.6  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  33.33 
 
 		 78 aa  41.2  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>