73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0232 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  100 
 
 		 71 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  69.44 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  66.67 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  63.89 
 
 		 75 aa  96.7  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  59.72 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  62.5 
 
 		 75 aa  94  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  63.89 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  59.72 
 
 		 75 aa  87.8  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  56.52 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  52.11 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  50 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  53.85 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  48.61 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  47.06 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  47.83 
 
 		 72 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  47.83 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  47.83 
 
 		 72 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  47.83 
 
 		 72 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  44.74 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  46.03 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  45.24 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  47.89 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  44.44 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  50 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  44.44 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  46.97 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.27 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  42.67 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  43.48 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2046  Like-Sm ribonucleoprotein core  44.87 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600722  normal  0.0639389 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  36.14 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  43.66 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  44.93 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  38.57 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0674  Like-Sm ribonucleoprotein core  44.93 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.973126  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  42.25 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.71 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  39.71 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.24 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0325  hypothetical protein  41.18 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  31.33 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  37.5 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.78 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  43.94 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  33.73 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00090  conserved hypothetical protein  31.88 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0822069  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  38.71 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  34.33 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  37.88 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  38.46 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  27.94 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1564  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.78 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10561  small nuclear ribonucleoprotein SmB, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07740)  40.58 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.199439 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03050  pre-mRNA splicing factor, putative  28.05 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.03026  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  39.71 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  38.57 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  40.98 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  37.31 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  35.09 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  36.11 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60825  predicted protein  24.71 
 
 		 112 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0777781  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1541  Like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 		 77 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.676832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32713  predicted protein  29.17 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02650  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 		 195 aa  41.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0190599  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35063  predicted protein  36.92 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  30.56 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10781  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSM4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12020)  34.33 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678126  normal  0.810635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1613  like-Sm ribonucleoprotein, core  31.88 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.18064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  40 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1205  like-Sm ribonucleoprotein, core  36 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0302379 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29422  predicted protein  40 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00200613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>