41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42364 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  100 
 
 		 89 aa  177  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  72.09 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  61.63 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  51.81 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  44.05 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.53 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  36.14 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.9 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  39.29 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  40.74 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.64 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  39.76 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.18 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.84 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  36 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  38.27 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  41.25 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  32.14 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60825  predicted protein  29.63 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0777781  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  39.51 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  40.96 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.15 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  36.99 
 
 		 79 aa  48.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  36.49 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35794  predicted protein  30.59 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  35.62 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.200547 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  36.49 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  32.53 
 
 		 287 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.49 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  36.14 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.78 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  32.93 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  33.75 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02650  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0190599  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03050  pre-mRNA splicing factor, putative  30.86 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.03026  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  39.53 
 
 		 129 aa  42  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 60 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00090  conserved hypothetical protein  39.62 
 
 		 216 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0822069  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33304  predicted protein  31.33 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00620413  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  36.99 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92531  predicted protein  34.55 
 
 		 239 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>