19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32713 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009361  OSTLU_32713  predicted protein  100 
 
 		 93 aa  186  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00090  conserved hypothetical protein  67.57 
 
 		 216 aa  98.2  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0822069  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  60.49 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10583  predicted protein  48.19 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329173  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_23784  predicted protein  41.33 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0444134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  28.41 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  29.17 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  30.67 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.85 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15709  predicted protein  36.21 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.365108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  40 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  27.78 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  29.17 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  36 
 
 		 74 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  36.21 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20588  predicted protein  32.56 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  38.6 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  26.39 
 
 		 72 aa  40  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>