11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_23784 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_23784  predicted protein  100 
 
 		 73 aa  144  5e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0444134  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  55.56 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00090  conserved hypothetical protein  50 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0822069  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32713  predicted protein  41.33 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10583  predicted protein  46.15 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329173  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03050  pre-mRNA splicing factor, putative  30.38 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.03026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  30 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15709  predicted protein  31.94 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.365108  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.91 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35794  predicted protein  28.92 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.46 
 
 		 287 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>