15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15709 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_15709  predicted protein  100 
 
 		 100 aa  204  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.365108  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29422  predicted protein  55 
 
 		 87 aa  100  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00200613 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  57.14 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02920  small nuclear ribonucleoprotein E, putative  56.47 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0578232  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06735  small nuclear ribonucleoprotein SmE, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05980)  48.84 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182783 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  30.56 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.62 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32713  predicted protein  36.21 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_23784  predicted protein  31.94 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0444134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10583  predicted protein  32.05 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329173  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  30.56 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  29.27 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0325  hypothetical protein  28 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  29.17 
 
 		 86 aa  40  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1541  Like-Sm ribonucleoprotein core  24.32 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.676832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>