28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_05679 on replicon BN001305
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  100 
 
 
129 aa  266  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00090  conserved hypothetical protein  60 
 
 
216 aa  99.8  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0822069  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32713  predicted protein  60.49 
 
 
93 aa  97.8  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10583  predicted protein  51.69 
 
 
94 aa  92.8  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329173  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_23784  predicted protein  55.56 
 
 
73 aa  84.3  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0444134  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.92 
 
 
72 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  31.82 
 
 
75 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  40.28 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  30.99 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  28.99 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  28.38 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15709  predicted protein  30.56 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.365108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  30.99 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  37.7 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  32 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  27.94 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.33 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9168  predicted protein  31.88 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  32.14 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0325  hypothetical protein  29.33 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29422  predicted protein  32.39 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00200613 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  39.53 
 
 
89 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02920  small nuclear ribonucleoprotein E, putative  34.38 
 
 
92 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0578232  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  25 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  35.29 
 
 
287 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1564  like-Sm ribonucleoprotein, core  31.51 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  25 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1205  like-Sm ribonucleoprotein, core  30.26 
 
 
79 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0302379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>