18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9168 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9168  predicted protein  100 
 
 		 87 aa  176  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05340  pre-mRNA splicing factor, putative  52.87 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0427818  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9203  predicted protein  52.38 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349989  normal  0.96374 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02007  small nuclear ribonucleoprotein SmD3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10240)  51.19 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000181433  normal  0.235611 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13864  predicted protein  49.41 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.440401  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_13887  predicted protein  50.62 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0943829 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  40.96 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  41.67 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  37.5 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10781  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSM4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12020)  37.5 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678126  normal  0.810635 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45936  predicted protein  36.05 
 
 		 598 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  34.72 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02105  small nuclear ribonucleoprotein SmD1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05110)  32.39 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349462 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12445  predicted protein  30.99 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0527627  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  31.88 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00200  pre-mRNA splicing factor, putative  32.81 
 
 		 121 aa  42  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0025  like-Sm ribonucleoprotein core  36 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.833597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  33.33 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>