17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05340 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB05340  pre-mRNA splicing factor, putative  100 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0427818  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02007  small nuclear ribonucleoprotein SmD3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10240)  59.82 
 
 		 116 aa  146  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000181433  normal  0.235611 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9203  predicted protein  60.47 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349989  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9168  predicted protein  52.87 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_13887  predicted protein  55.56 
 
 		 97 aa  103  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0943829 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13864  predicted protein  44.58 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.440401  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  40.28 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  33.33 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  37.18 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10781  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSM4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12020)  37.5 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678126  normal  0.810635 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45936  predicted protein  37.21 
 
 		 598 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02105  small nuclear ribonucleoprotein SmD1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05110)  31.94 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349462 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  30.56 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12445  predicted protein  29.58 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0527627  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.85 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00200  pre-mRNA splicing factor, putative  33.85 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.03 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>