18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00200 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB00200  pre-mRNA splicing factor, putative  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000299914  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02105  small nuclear ribonucleoprotein SmD1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05110)  67.39 
 
 		 121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349462 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12445  predicted protein  64.63 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0527627  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10658  predicted protein  61.02 
 
 		 56 aa  73.6  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.075998  normal  0.347619 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_51100  predicted protein  54.88 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.079592  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02007  small nuclear ribonucleoprotein SmD3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10240)  34.45 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000181433  normal  0.235611 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10494  predicted protein  39.13 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10963  small nuclear ribonucleoprotein (LSM2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15210)  36.56 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.647481 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05340  pre-mRNA splicing factor, putative  30.68 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0427818  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  37.1 
 
 		 115 aa  47.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  27.62 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01770  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm2, putative  33.71 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368252  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  34.38 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  34.41 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10781  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSM4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12020)  31.25 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678126  normal  0.810635 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45936  predicted protein  32.91 
 
 		 598 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50259  snRNA-associated protein, Sm class  34.83 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0481772 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9168  predicted protein  32.81 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>