22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12601 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  100 
 
 		 115 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10781  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSM4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12020)  64.2 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678126  normal  0.810635 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  48.67 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  50 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  46.39 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05340  pre-mRNA splicing factor, putative  40.28 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0427818  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02007  small nuclear ribonucleoprotein SmD3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10240)  33.33 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000181433  normal  0.235611 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9168  predicted protein  37.5 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  36.25 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_13887  predicted protein  31.91 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0943829 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9203  predicted protein  36.11 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349989  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12445  predicted protein  45.76 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0527627  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00200  pre-mRNA splicing factor, putative  37.1 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000299914  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02105  small nuclear ribonucleoprotein SmD1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05110)  33.75 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349462 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10494  predicted protein  29.33 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50259  snRNA-associated protein, Sm class  31.43 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0481772 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10963  small nuclear ribonucleoprotein (LSM2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15210)  29.63 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.647481 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01770  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm2, putative  31.17 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368252  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45936  predicted protein  31.11 
 
 		 598 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  31.75 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1057  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.33 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0835577 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13864  predicted protein  27.78 
 
 		 95 aa  40  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.440401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>