17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54497 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10781  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSM4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12020)  66.67 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678126  normal  0.810635 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  53.76 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  54.88 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  48.94 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9168  predicted protein  41.67 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02007  small nuclear ribonucleoprotein SmD3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10240)  29.73 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000181433  normal  0.235611 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05340  pre-mRNA splicing factor, putative  30.56 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0427818  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13864  predicted protein  33.33 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.440401  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  31.34 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9203  predicted protein  34.25 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349989  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00200  pre-mRNA splicing factor, putative  33.33 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_13887  predicted protein  31.94 
 
 		 97 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0943829 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  30.3 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  31.51 
 
 		 81 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  38.89 
 
 		 80 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  27.47 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>