18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12445 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_12445  predicted protein  100 
 
 		 114 aa  230  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0527627  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02105  small nuclear ribonucleoprotein SmD1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05110)  62.24 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349462 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10658  predicted protein  100 
 
 		 56 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.075998  normal  0.347619 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_51100  predicted protein  64.77 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.079592  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00200  pre-mRNA splicing factor, putative  64.56 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000299914  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10963  small nuclear ribonucleoprotein (LSM2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15210)  34.62 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.647481 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05340  pre-mRNA splicing factor, putative  29.63 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0427818  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  45.76 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02007  small nuclear ribonucleoprotein SmD3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10240)  25.71 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000181433  normal  0.235611 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  31.52 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  31.17 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10494  predicted protein  31.58 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50259  snRNA-associated protein, Sm class  32.61 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0481772 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9168  predicted protein  30.99 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01770  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm2, putative  31.4 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368252  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9203  predicted protein  28.17 
 
 		 95 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349989  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  35.48 
 
 		 147 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  31.43 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>