15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10494 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_10494  predicted protein  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50259  snRNA-associated protein, Sm class  56.32 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0481772 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  55.68 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01770  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm2, putative  52.94 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368252  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10963  small nuclear ribonucleoprotein (LSM2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15210)  53.33 
 
 		 98 aa  97.1  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.647481 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02105  small nuclear ribonucleoprotein SmD1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05110)  32.63 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349462 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14530  predicted protein  32.1 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241095 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00200  pre-mRNA splicing factor, putative  40 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  28.57 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  25 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12445  predicted protein  31.18 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0527627  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  29.33 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10781  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSM4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12020)  32 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678126  normal  0.810635 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  40 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1057  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.46 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0835577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>