18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7848 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  100 
 
 		 135 aa  273  8e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  52.13 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  53.06 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  49.45 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10781  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSM4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12020)  51.9 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678126  normal  0.810635 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9168  predicted protein  40.96 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02007  small nuclear ribonucleoprotein SmD3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10240)  33.98 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000181433  normal  0.235611 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05340  pre-mRNA splicing factor, putative  36 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0427818  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9203  predicted protein  36.49 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349989  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_13887  predicted protein  35.21 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0943829 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  32.35 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  30.12 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10494  predicted protein  23.47 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01770  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm2, putative  31.25 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368252  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13864  predicted protein  29.73 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.440401  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45936  predicted protein  31.63 
 
 		 598 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  29.87 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50259  snRNA-associated protein, Sm class  21.69 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0481772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>