20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10781 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_10781  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSM4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12020)  100 
 
 		 119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678126  normal  0.810635 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  60.82 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  61.36 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  52.68 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  50 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02007  small nuclear ribonucleoprotein SmD3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10240)  32.76 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000181433  normal  0.235611 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05340  pre-mRNA splicing factor, putative  37.5 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0427818  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9168  predicted protein  37.5 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9203  predicted protein  37.5 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349989  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_13887  predicted protein  36.11 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0943829 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14530  predicted protein  28.57 
 
 		 123 aa  47.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241095 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13864  predicted protein  34.18 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.440401  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  26.8 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10494  predicted protein  28.57 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00200  pre-mRNA splicing factor, putative  32.26 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000299914  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  31.88 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  31.43 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  31.51 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02105  small nuclear ribonucleoprotein SmD1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05110)  27.17 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349462 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  32.88 
 
 		 87 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>