30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0138 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  100 
 
 		 74 aa  146  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  67.57 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  69.23 
 
 		 65 aa  94.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1613  like-Sm ribonucleoprotein, core  56.34 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.18064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1541  Like-Sm ribonucleoprotein core  52.86 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.676832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1564  like-Sm ribonucleoprotein, core  52.86 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1205  like-Sm ribonucleoprotein, core  50 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0302379 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0325  hypothetical protein  55.71 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  38.89 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  37.5 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  49.12 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  36.23 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.48 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.36 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  32.86 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  39.13 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  30.88 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  38.24 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.85 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  36.36 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  34.85 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  39.39 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  43.86 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  39.29 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.88 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  32.81 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01500  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm6, putative  27.78 
 
 		 88 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919907  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.29 
 
 		 80 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10494  predicted protein  40 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  25.35 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>