25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01500 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN01500  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm6, putative  100 
 
 		 88 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919907  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  53.97 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  54.41 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  41.67 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  36.11 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  39.71 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.53 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  40.7 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  37.5 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  40.58 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.53 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  37.97 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  38.16 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  36.99 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  31.94 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  34.72 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  34.72 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  33.8 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.36 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  27.78 
 
 		 74 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  31.34 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.8 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  29.17 
 
 		 80 aa  40  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  36.36 
 
 		 80 aa  40  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>