37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20167 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  100 
 
 		 87 aa  179  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  67.09 
 
 		 79 aa  114  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  66.67 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  54.55 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  47.95 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  44.93 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  46.03 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01500  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm6, putative  40.58 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  41.79 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  38.16 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.27 
 
 		 80 aa  50.1  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  32.43 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.1 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.36 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.49 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.39 
 
 		 80 aa  47.4  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  37.88 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  41.82 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  41.27 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  37.88 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.71 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  32.43 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.71 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.67 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.68 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  39.68 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1613  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.44 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.18064 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.96 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.51 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  37.31 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.36 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.74 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  38.1 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  35.06 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1564  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.78 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.14 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  33.87 
 
 		 78 aa  40  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>