45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10719 on replicon BN001305
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  100 
 
 		 80 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  57.81 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01500  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm6, putative  54.41 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919907  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  44.78 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  42.03 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  40 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  43.28 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  37.5 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  38.57 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.67 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  32.84 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  38.57 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  32.86 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  35.29 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.23 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  31.75 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  36.49 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.11 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  35.62 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  37.7 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1613  like-Sm ribonucleoprotein, core  46.67 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.18064 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  37.31 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.11 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  37.31 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.78 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.31 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  36.36 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.33 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  35.82 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.62 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.29 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  31.88 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  29.17 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.82 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  35.62 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1205  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.82 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0302379 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  35.21 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1541  Like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.676832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.29 
 
 		 87 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  29.17 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1564  like-Sm ribonucleoprotein, core  29.41 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  31.34 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  32.84 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>