43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0866 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  100 
 
 		 86 aa  172  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  50 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  50 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  45.71 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  45.33 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  48 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.67 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.05 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  44.29 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  37.8 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  44.29 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  45.45 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  38.57 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  40.85 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  40 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  42.42 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  38.03 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  40 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.67 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  34.67 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  34.67 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.34 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  39.44 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  35.53 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  37.7 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01500  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm6, putative  33.33 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.25 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.31 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.07 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  36.07 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  32.43 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  38.1 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  34.38 
 
 		 80 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.82 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  38.81 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  32.79 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  32.89 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  33.77 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  32 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  31.4 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1541  Like-Sm ribonucleoprotein core  31.94 
 
 		 77 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.676832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>