42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0290 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  100 
 
 		 71 aa  143  9e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  77.78 
 
 		 72 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  77.78 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  77.78 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  77.78 
 
 		 72 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  47.06 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  46.15 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  42.65 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  49.21 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  42.65 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  49.09 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.57 
 
 		 80 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.1 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  47.62 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.71 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  49.21 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  43.48 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  47.62 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  46.03 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  45.31 
 
 		 80 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  40 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  46.03 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  38.67 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.18 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.18 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  38.24 
 
 		 86 aa  47.4  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  41.18 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.5 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.765143 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.5 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  38.57 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0674  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.88 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.973126  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  34.57 
 
 		 287 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  34.15 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2046  Like-Sm ribonucleoprotein core  36 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600722  normal  0.0639389 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.72 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  35.21 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  36.71 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.29 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>