41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0736 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  100 
 
 		 100 aa  206  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  54.67 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  50.67 
 
 		 87 aa  76.6  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  48 
 
 		 86 aa  67.8  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  43.84 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  44.93 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  46.27 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  48.44 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.78 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  45.31 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  42.65 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  40.58 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  40.58 
 
 		 72 aa  52.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  45.9 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.24 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01500  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm6, putative  40.58 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919907  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  42.03 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  40.91 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  34.78 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.24 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  30.12 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  40 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  48.21 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  44.64 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.07 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  44.64 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  42.03 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  43.28 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  37.14 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.06 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  41.38 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  33.82 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  34.29 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  23.86 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  31.51 
 
 		 88 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  30.3 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  34.92 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  27.16 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  39.13 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  34.29 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>