31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46368 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  100 
 
 		 78 aa  159  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  53.33 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  56 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  50.67 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  47.95 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  40.32 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01500  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm6, putative  38.16 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919907  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.79 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  36.49 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  43.55 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.54 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  39.44 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  35.21 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  43.94 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  34.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.72 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  38.57 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  38.57 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  42.42 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  28.57 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50259  snRNA-associated protein, Sm class  36.23 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0481772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  40.91 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1613  like-Sm ribonucleoprotein, core  29.69 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.18064 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  32.39 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  30.99 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  32.89 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  34.92 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  35.82 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  36.36 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.67 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>