15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_50259 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_50259  snRNA-associated protein, Sm class  100 
 
 		 94 aa  195  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0481772 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10963  small nuclear ribonucleoprotein (LSM2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15210)  68.18 
 
 		 98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.647481 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  59.77 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10494  predicted protein  56.32 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01770  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm2, putative  64.56 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368252  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12445  predicted protein  31.87 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0527627  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14530  predicted protein  28.99 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241095 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45936  predicted protein  33.7 
 
 		 598 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  29.49 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.21 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  36.23 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.87 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02105  small nuclear ribonucleoprotein SmD1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05110)  31.46 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349462 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  21.95 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  31.34 
 
 		 86 aa  40  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>