18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28777 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  100 
 
 		 130 aa  263  7e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10963  small nuclear ribonucleoprotein (LSM2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15210)  66.29 
 
 		 98 aa  116  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.647481 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50259  snRNA-associated protein, Sm class  59.77 
 
 		 94 aa  114  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0481772 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01770  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm2, putative  63.41 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368252  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10494  predicted protein  55.68 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774867  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  36.36 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  32.35 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  34.83 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12445  predicted protein  29.07 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0527627  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  36.36 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02105  small nuclear ribonucleoprotein SmD1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05110)  35.44 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.349462 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00200  pre-mRNA splicing factor, putative  36 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000299914  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  30.3 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14530  predicted protein  31.88 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241095 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10781  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSM4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12020)  31.43 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678126  normal  0.810635 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  33.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  35.82 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9168  predicted protein  33.33 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>