27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8518 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  100 
 
 		 66 aa  137  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  57.81 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01500  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm6, putative  53.97 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919907  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  49.21 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  46.03 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  41.27 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  37.1 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  39.06 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.44 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  34.38 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  37.1 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  40 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  40 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  32.26 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  38.71 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.66 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.24 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  34.33 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.93 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  37.93 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  32.81 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  31.75 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.206988 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  37.93 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28777  predicted protein  33.33 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000754445  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.92 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>