30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10966 on replicon BN001304
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  100 
 
 		 88 aa  181  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  52.7 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  57.53 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  55.41 
 
 		 87 aa  82  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46368  predicted protein  50.67 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.674682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  40.79 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  40 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.5 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  42.19 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.26 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  39.06 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  40.62 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01500  u6 snRNA-associated sm-like protein lsm6, putative  37.97 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.919907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  36.62 
 
 		 74 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  29.17 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  38.81 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  37.31 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.47 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1613  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.1 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.18064 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.68 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.1 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.33 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  34.33 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.14 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  38.1 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  36.51 
 
 		 80 aa  43.9  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  38.98 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.51 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.18 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1564  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.33 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>