54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0041 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  96.25 
 
 		 80 aa  159  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  92.41 
 
 		 80 aa  154  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  91.14 
 
 		 80 aa  152  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  52 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  56.92 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  54.29 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  52.24 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  51.72 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  52.63 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  49.12 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  43.75 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  53.03 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  46.03 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  47.37 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  46.15 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  40.62 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  45.61 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.78 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  42.19 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  47.62 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39384  predicted protein  47.14 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.447648  normal  0.30848 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0349  like-Sm ribonucleoprotein core  36.36 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1181  Like-Sm ribonucleoprotein core  43.94 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00764274  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  43.55 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  39.39 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  41.94 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.39 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00778138 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  36.49 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  34.85 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68190  predicted protein  34.07 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.502273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.85 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10966  small nuclear ribonucleoprotein SmF, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15500)  38.1 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0013173  normal  0.021031 
 
 
-
 
NC_006686  CND03220  mRNA processing-related protein, putative  43.55 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06350  RNA cap binding protein, putative  36.84 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  36.07 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20167  predicted protein  39.68 
 
 		 87 aa  43.9  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  37.68 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34727  predicted protein  40.35 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  31.82 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  37.93 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  33.78 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.94 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  39.06 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  34.85 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  31.25 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  35.48 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  34.92 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  32.89 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  39.06 
 
 		 72 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33304  predicted protein  31.51 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00620413  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  39.06 
 
 		 72 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.06 
 
 		 72 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  38.36 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>