16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1205 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1205  like-Sm ribonucleoprotein, core  100 
 
 		 79 aa  157  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0302379 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1613  like-Sm ribonucleoprotein, core  69.23 
 
 		 78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.18064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1564  like-Sm ribonucleoprotein, core  65.38 
 
 		 78 aa  107  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1541  Like-Sm ribonucleoprotein core  67.95 
 
 		 77 aa  104  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.676832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0325  hypothetical protein  70.51 
 
 		 77 aa  103  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0138  like-Sm ribonucleoprotein, core  50 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3597  small nuclear riboprotein-like protein  45.21 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0124482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0177  small ribonucleoprotein  42.19 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  32 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.92 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  27.03 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  34.92 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  40.82 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10719  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06325)  41.82 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000682628 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  36 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  30.26 
 
 		 129 aa  40  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>