15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02007 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02007  small nuclear ribonucleoprotein SmD3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10240)  100 
 
 
116 aa  233  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000181433  normal  0.235611 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05340  pre-mRNA splicing factor, putative  59.82 
 
 
124 aa  146  9e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0427818  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_13887  predicted protein  61.73 
 
 
97 aa  114  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0943829 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9203  predicted protein  54.88 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349989  normal  0.96374 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9168  predicted protein  51.19 
 
 
87 aa  101  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13864  predicted protein  42.68 
 
 
95 aa  77.4  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.440401  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12601  predicted protein  34.72 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.206988 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05120  glycine rich protein, putative  31.53 
 
 
117 aa  57.8  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_7848  predicted protein  33.78 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.957276  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10781  U6 snRNA-associated Sm-like protein LSM4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12020)  31.94 
 
 
119 aa  51.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.678126  normal  0.810635 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54497  predicted protein  30.56 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.142266  normal  0.642668 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00200  pre-mRNA splicing factor, putative  37.33 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000299914  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02105  small nuclear ribonucleoprotein SmD1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05110)  29.58 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.349462 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12445  predicted protein  25.35 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0527627  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45936  predicted protein  32.56 
 
 
598 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>