14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00090 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA00090  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0822069  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  60 
 
 		 129 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32713  predicted protein  67.57 
 
 		 93 aa  98.2  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_23784  predicted protein  50 
 
 		 73 aa  77  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0444134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10583  predicted protein  49.37 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329173  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.57 
 
 		 72 aa  47.8  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  31.88 
 
 		 71 aa  45.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  36.73 
 
 		 75 aa  45.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  30.43 
 
 		 72 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  37.31 
 
 		 75 aa  42.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0325  hypothetical protein  34.25 
 
 		 77 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  36.21 
 
 		 97 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  28.99 
 
 		 72 aa  41.6  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  39.62 
 
 		 89 aa  41.6  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>