26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47366 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_47366  predicted protein  100 
 
 		 90 aa  184  5e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06735  small nuclear ribonucleoprotein SmE, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05980)  59.77 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182783 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15709  predicted protein  57.14 
 
 		 100 aa  97.1  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.365108  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02920  small nuclear ribonucleoprotein E, putative  52.81 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0578232  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29422  predicted protein  50 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00200613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  45.83 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32713  predicted protein  28.41 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05679  small nuclear ribonucleoprotein (LSM5), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04280)  32 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  29.58 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  30.56 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10583  predicted protein  32.47 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329173  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.13 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.72 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  28.99 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  30.51 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0736  like-Sm ribonucleoprotein, core  30.3 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0227658  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  40.43 
 
 		 131 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  34.69 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  34 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  34.72 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  32 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  35.85 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  30.56 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  30 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  33.33 
 
 		 76 aa  40  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00090  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 		 216 aa  40.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0822069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>