37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10007 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  100 
 
 
96 aa  193  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  61.63 
 
 
89 aa  102  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  58.82 
 
 
88 aa  102  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  56.98 
 
 
97 aa  97.8  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  52.87 
 
 
95 aa  90.5  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  41.1 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.1 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  42.47 
 
 
73 aa  55.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.27 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  42.17 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  37.8 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.44 
 
 
76 aa  52  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  37.8 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.23 
 
 
80 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  37.5 
 
 
71 aa  50.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  36.99 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35794  predicted protein  31.76 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60825  predicted protein  29.27 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0777781  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  39.51 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03050  pre-mRNA splicing factor, putative  32.93 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.03026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.75 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  35 
 
 
287 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.14 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  39.24 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  36.76 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33304  predicted protein  33.82 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00620413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  36.71 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  36.71 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  36.71 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.71 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  38.36 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  38.75 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  36.71 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  35 
 
 
60 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  36.99 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.36 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.76 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>