27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2046 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2046  Like-Sm ribonucleoprotein core  100 
 
 		 80 aa  159  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600722  normal  0.0639389 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2924  Like-Sm ribonucleoprotein core  60.98 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1066  Like-Sm ribonucleoprotein core  57.32 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2097  Like-Sm ribonucleoprotein core  60.76 
 
 		 60 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.765143 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  42.31 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0674  Like-Sm ribonucleoprotein core  47.44 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.973126  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  40 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  43.04 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  41.03 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.77 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  41.03 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  41.77 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0470  like-Sm ribonucleoprotein core  37.66 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.31317  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0398  like-Sm ribonucleoprotein core  37.66 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1521  like-Sm ribonucleoprotein core  37.66 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0711074  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0437  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.66 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  39.24 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  40.51 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0290  like-Sm ribonucleoprotein core  38.67 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  32.43 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  35.62 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8518  predicted protein  35.71 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  38.03 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0086  like-Sm ribonucleoprotein core  33.33 
 
 		 81 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.514735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  36.62 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  31.51 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0653  Like-Sm ribonucleoprotein core  33.78 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>